Piousbox

Autor:Jon Fleetwood, viaSubstack,

Um amplo e multi-institucional esforço para "prever" as características futuras do patógeno, desenvolver vacinas "antes da necessidade", e construir os próprios sistemas destinados a validar essas previsões.

A Defense Advanced Research Projects Agency (DARPA) passou o início da década de 2010 construindo o que poderia ter sido a mais ambiciosa infraestrutura preditiva de desenvolvimento vacinal já tentada: um amplo e multi-institucional esforço projetado para determinar as características futuras dos supostos patógenos antes de surgirem e, em última análise, usar essas previsões para desenvolver medicamentos e vacinas antes de serem necessárias.

O programa, conhecido comoPROFECIA—short for Pathogen Defeat— foi anunciado em 2010 sobAnúncio de ampla agência DARPA-BAA-10-93e foi gerido pelo Departamento de Ciências da Defesa da DARPA.

A DARPA em si descreveu o objetivo vacinal do programa de forma inequívoca.

Segundo a agência: “O programa Profecy (Pathogen Defeat) explorará a evolução dos vírus na esperança de prever mutações virais e, em última análise, desenvolver medicamentos e vacinas antes da necessidade.”

O esforço não se limitou a coronavírus, influenza ou qualquer outra categoria de doença única.

A DARPA afirmou repetidamente que o objetivo era compreender: “a evolução natural de qualquer vírus”.

O resultado foi uma arquitetura maciça que reuniu pesquisadores de aprendizado de máquina, estatísticos, bioinformáticos, biólogos computacionais, cientistas de laboratório, especialistas em vigilância, universidades, empreiteiros e laboratórios nacionais em um único quadro “preditivo”.

Ontem, este sitenotificadoque o programa PROPHECY da DARPA se expandiu para o laboratório do pesquisador de coronavírus Ralph Baric anos antes da pandemia de COVID-19 e quase uma década antes da proposta DARPA/DEFUSE documentou todas as três características estruturais definidoras da proteína pico SARS-CoV-2 antes do surto.

DARPA queria transformar o desenvolvimento da vacina de reativa para preditiva

A DARPA acreditava abertamente que o desenvolvimento da vacina existente operava de forma inversa.

A agência descreveu o modelo farmacêutico moderno como: “observação e reativa.”

PROFECIA destinava-se a substituir esse modelo por um que fosse: “preditivo e preventivo.”

Ao invés de esperar que futuras supostas ameaças de doenças surgissem antes de iniciar o processo de caracterização e desenvolvimento de contramedidas, a DARPA buscou sistemas capazes de determinar antecipadamente as características das futuras populações de patógenos.

Tudo na PROFECIA fluiu desse objetivo.

Construindo o Plano Antes do Patógeno

As ambições da DARPA foram muito além das previsões de surtos.

A agência declarou: “A DARPA procura alcançar a capacidade de prever com sucesso a evolução natural de qualquer vírus, através de plataformas e algoritmos capazes de monitorar eventos virais raros e vantajosos...”

O programa buscou sistemas capazes de determinar:

• mutações futuras,
• futuras reafirmações,
• acontecimentos genéticos futuros,
• a ordem em que surgiriam mutações,
• relações genótipo-fenótipo,
• e, em última análise, as características das futuras populações de patógenos.

A DARPA reconheceu: “no momento, não há capacidade confiável para prever o reassorte viral ou mutações responsáveis pelo surgimento de novas cepas virais.”

A sua solução proposta foi: “Uma plataforma investigativa para prever mutações e, possivelmente, reassentamentos antes de sua ocorrência.”

A agência explicou ainda que PROFECIA buscou: “ algorítmos preditivos de evolução viral que são informados e validados experimentalmente usando plataformas biológicas de alto rendimento...” e: “a integração de uma plataforma de evolução viral com um algoritmo que prediz mutações que conferem uma vantagem evolutiva à população viral.”

Entre os requisitos formais do programa estava a capacidade de: “reprodutivelmente prever os atributos genômicos, proteômicos e/ou funcionais da população viral final”.

DARPA também procurou determinar: “a taxa e ordem de aquisição de mutação”assim como: “a correlação do genótipo com o fenótipo.”

O objetivo não era apenas mutações individuais.

Foi a própria população de desfecho.

A predição era apenas a primeira camada

PROFECIA nunca foi projetada para parar na previsão.

A DARPA exigiu que os participantes construíssem o que chamava: “Sistemas de validação biológica” e enfatizaram repetidamente: “teste e validação do sistema e algoritmo”.

O BAA instruiu os intérpretes a: “Fazer um teste “mundo real” do algoritmo preditivo e do sistema de validação biológica...”

O objetivo desse exercício era determinar se os pesquisadores poderiam: “reprodutivamente prever os atributos genômicos, proteômicos e/ou funcionais da população viral final”.

A DARPA instruiu os participantes a: “desenvolver uma estratégia de pesquisa e solicitar colaborações de parceiros” que auxiliar em: “aplicar sua metodologia preditiva aos dados de vigilância do mundo real.”

A arquitetura descrita por PROFECIA, portanto, se estendeu além da predição.

O programa buscou construir sistemas capazes não só de gerar projetos futuros de patógenos, mas também de tentar validar essas previsões experimentalmente e por meio de quadros observacionais subsequentes.

Linha inferior

No meio de debates COVID-19, a atenção pública tem se concentrado em programas posteriores, como DEFUSE, ADEPT, plataformas de mRNA pandêmicas e Operação Velocidade de Dobra.

Mas PROFECIA confirma que, em 2010, a DARPA estava abertamente tentando construir uma infraestrutura preditiva generalizada capaz de decidir as características futuras dos supostos patógenos, utilizando essas predições para possibilitar medicamentos e vacinas com antecedência, e construindo sistemas destinados a validar essas predições experimentalmente e por meio de quadros observacionais posteriores.

Mais importante ainda, o esforço nunca foi destinado a uma única doença.

PROFECIA procurou construir esta capacidade para: “qualquer vírus”.

Seja vista como biodefesa preditiva, genômica antecipatória, desenvolvimento de contramedidas preventivas ou outra coisa, a arquitetura descrita pela DARPA seguiu uma sequência notavelmente consistente:

• O objectivo das vacinas;
• Planos futuros de agentes patogénicos como tecnologia facilitadora;
• Sistemas de “validação” como camada final.

Essa arquitetura pode, em última análise, ser um dos desenvolvimentos mais consequentes e menos compreendidos na história da pesquisa moderna de biodefesa.